会计集中核算是新形势下的新事物，已有不少地区开始运作。但从全国范围看，还没有统一实行，当然也谈不上有统一的运行法则了。会计集中核算目前需要研究和探讨的问题很多，研究处理好这些问题，工作中可以少走弯路，获得事半功倍的效果。
一、汇总报账单问题
从推行会计集中核算的一般情况看，集中核算单位(以下称“单位”)的报账员，在到会计核算中心(以下称“中心”)报账前，对各种费用单据的整理和准备程序为：分类整理各种费用原始发票(领导已审批，且已用各用金支付)→分类汇总填写“费用报销单”→汇总“费用报销单”，填写“汇总投报账单”。报账员到“中心”报账时，“中心”会计和会计主管的审核程序是：原始单据→费用报销单→汇总报账单，要核对“费用报销单”和“汇总报账单”金额的大、小写项审报数及所附原始凭证张数、支付方式等，遇到报账员填写的科目(项目)划分错误、金额填写错误等，要分别在“费用报销单”和“汇总报账单”上进行纠正。如此一来，如果“单位”一次报账的单据少的话，报账时间不会太长。若单据多的话，势必造成报账时间过长，影响各方面的工作效率。经过调研和实践，我们把“报账汇总单”这一环节去掉，要求报账员报账时只填写“费用报销单”，至于“报账员”对费用项目确认准确与否，由柜组会计审定时认定。柜组会计和会计主管据审核无误后的原始凭证和“费用报销单”加总计算报账金额，并据以填开“现金支票”，补足“备用金”。这样做，节约了报账时间，减少了报账员和“中心”会计人员的工作量，提高了工作效率。
二、银行预留印鉴问题
银行预留单位(核算中心)财务专用章和柜组会计、会计主管、报账员三人印章，且分别保管。至于为何不留“单位”法人印鉴，是因为到“中心”报账的每笔业务都是经单位领导签字的，留报账员印章，可以增强报账员的责任心。报账员每次报账(包括转账、拨款等)时，自带、自盖个人印章。这样，建立三方相互牵制机制，避免过去名义上单位预留法人、会计和出纳印章，实际上法人印章常存会计处，由会计、出纳二人进行操作，因而造成漏洞(这方面的事例不少)。至于一级预算单位下属二级预算单位多，每次拨款都要一级单位报账员同来，而一级单位报账员大多为兼职，工作量大的问题，可以采用一级单位报账员到“中心”申领一本转账支票(仅限于拨款用)，逢拨款时，由其根据单位财务主管签写的“拨款单”，填制“转账支票”，并加盖自己预留银行的印章，将拨款单、转账支票及存根交二级单位报账员，到“中心”进行拨款。“中心”工作人员审核拨款单、“转账支票”后，加盖预留银行的财务专用章和柜组会计、会计主管印章，填写“进账单”，留下“转账支票”存根，其它交二级单位报账员到银行专柜转账。然后，再根据“拨款单”和“转账支票”存根做账。
三、备用金的核定问题
备用金主要根据各核算单位人员编制规模的大小、经济业务的多少、距离“中心”的远近来核定。一般地说，对单位人员编制规模比较大、经济业务较多、距离“中心”比较远的单位，按3～4天资金需要量核定;对距离“中心”比较近的单位，按2～3天资金需要量掌握。对单位人员编制规模比较小，经济业务比较少的单位，按4～5天资金需要量掌握。对一些突发或需要用较多现金的事项，特殊对待，随到随办。这样处理，至少有以下好处：一是每次报账提现不多，减少了报账员的路途风险和资金保管风险;二是每次报账，各种原始票据不会很多，方便审查，节约报账时间，提高工作效率。
四、现金解缴和“坐支”问题
会计制度规定：单位不得“坐支”现金，即不得以本单位的现金收入支付现金支出。但在实际工作中，各单位多少都有“坐支”现象，而且是先斩后奏，“中心”也找不到刚性制裁的法规依据。无奈，只好采取变通的手法，即报账员报账时，收入和支出分别填写“现金收入报账单”、“银行现金交款单”和“费用报销单”，“中心”会计审核“费用报销单”和“现金收入报账单”后，按“费用报销单”汇总数填开“现金支票”，加盖齐银行预留印鉴后，文报账员到银行专柜提现。银行专柜把“现金支票”金额数和报账员提交的“银行现金交款单”金额数相抵后，给其付现，并在“银行现金交款单”上签“现金解论”章，由报账员交“中心”会计，与“现金收入报账单”一并入账。如此处理，从理论上讲，有悖于国家财经纪律，但从实际效果看，不失为一种比较现实的处理方法，核算单位、会计核算中心和银行均认为，而且事后从会计核算资料上，也看不出什么不妥。同时，也避免了报账员携现金到银行专门解缴，报账员又提大量现金回单位，从而减少了工作量，也有利于国家资金的安全，提高了核算单位、“中心”和银行的工作效率。
